I 846 åpnet Carl Zeiss et lite verksted for produksjon av optiske presisjonsinstrumenter på 7 Neugasse Street i Jena.
I 1866 ble det 1000. mikroskopet solgt. Mr. ErnstAbbe slutter seg til Mr. Zeiss sitt selskap og har etablert Zeiss sin mikroskopiteknologi på vitenskapelig grunnlag.
1884-1891: «Schott & Gemossen Glass Works» i Jena er etablert, Carl Zeiss døde i 1888, Carl Zeiss Foundation er etablert.
I 1900, med hjelp av August Köhler, begynte Mr. Zeiss' lille verksted å ekspandere globalt og la på samme måte et solid grunnlag for fluorescensmikroskopi.
I 1936, i samarbeid med Mr. Frits Zernike, ble det første fasekontrastmikroskopet for analyse av levende celler introdusert. Mr. Frits Zernike ble tildelt Nobelprisen i fysikk i 1953.
1949, Economic Miracle and the Electronic Age: Kommersialisering av transmisjonselektronmikroskopi i samarbeid med AEG Corporation.
I 1989 ble graden av digitalisering høyere og høyere, og mikroskopet ble en bildebehandlingsarbeidsstasjon. Den raskt utviklede programvareteknologien og digitalkameraet utvidet bruksområdet til mikroskopet.
I 2000 hjalp operasjonskontrollteknologien bildeteknologien, og mikroskopet ble et automatisert bildevisningssystem.
